[求救] 關於pGL3 cloning
看板Biotech (生命科學)作者SIMOYA (TAIPEI ARENA (灑花~~~))時間14年前 (2011/11/06 18:40)推噓1(1推 0噓 1→)留言2則, 2人參與討論串1/1
大家好
小妹目前在進行一段基因的promoter cloning想作promoter assay
其中promoter cloning的3' primer設計有超過這段基因的ATG
*目前clone出的圖示: -1936 0 +80
--------------ATG------------
目前欲將這個clone到的putative promoter接到pGL3 vector上
想請教的是 這段基因是否需要和pGL3上的luciferase共用ATG?
也就是:
-----------------------ATG---------------
putative promoter luciferase (畫圖技術不好請見諒><)
但目前發現pGL3 vector map上 luc+位置 只有Nco I 切位
不巧的是 我這個基因片段有兩個Nco I切位阿~!!><
如果我3' primer 重新設計Nco I切位作PCR, P出這段基因的ATG以前的部分
到時要切Nco I再接到pGL3上,也會一起將我的片段切了orz
(有想過就硬著頭皮做酵素切位相同的正反接,但以前實在有很慘痛的回憶orz)
看了已經畢業的學姊論文,發現她沒用Nco I切位,
也就是她將她的promoter直接選兩個pGL3 MCS切位, 接到pGL3 vector上
但問了現在lab中的學長,他說他是將預測的promoter與luciferse共用ATG,
因為luciferase ATG之前的序列都會影響luciferse的活性,
想請問大家 目前該怎麼辦? 要硬做切位相同的cloning嗎?
(重點是切了之後 其中兩個片段大小都是七百 根本分不開orz)
謝謝大家>< ~
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