Re: [求救] 用舊的agarose gel跑RNA

看板Biotech (生命科學)作者 (才女)時間14年前 (2011/11/12 00:16), 編輯推噓3(302)
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※ 引述《pocession (阿宗)》之銘言: : ※ 引述《rockerwei (才女)》之銘言: : : 不過我們實驗室也只有用DNA maker來看18s和28s是不是對的 : : DNA maker跑得很正常 : : (RNA有特別的maker嗎?) : : 我們的膠只是單純放在一般的保鮮盒 : : buffer已經跑到都要不行了 : : 所以還是要用全新的膠全新的buffer來跑會比較好就對了 : : (因為實驗室check PCR pruduct也都是用舊得膠舊的buffer跑~但band都很正常) : : 因為在以前的實驗室都是要跑才做膠所以RNA也都是正常的 : : (而且還有先denature處理過才跑,做的膠有外加ATA) : : 所以不確定是因為跑舊膠的問題還是沒有經過denature的處理 : : (現在的實驗室有點窮,所以都沒有處理RNA就直接跑了~) : 嗯 可能我的意思讓你有點誤解 : 要跑RNA Marker的原因有兩個 : 一個是DNA的分子量沒有辦法代表RNA (DNA為雙股,RNA為單股,單體的分子量也不一樣) : 另一個是確保你在SAMPLE prepare或是跑膠的過程中RNA沒有分解 : (如果跑膠的流程中出錯,RNA marker就會分解了,以此作為判斷) : 所以你用DNA marker作比較,是沒辦法作任何判斷的 : 另外,根據我的經驗,膠的新鮮與否並不是很直接的影響 : 主要是跟你放置的容器和跑膠的buffer有很大的關係 : 容器要乾淨,跑膠的buffer儘量滅過菌,然後要跑時再稀釋(要用二次水), : 如果要把RNA sample作變性處理 : 可以自己配製含formaldehyde的loading buffer就好了,滿便宜的 : 如果不想買RNA marker,可以自己用acid phenol抽新鮮的大腸桿菌(養至對數期的細菌) : 裡面會有5S, 16S, 23S;可以幫助你判斷位置和跑膠流程有沒有發生問題 再求救一次~我這次已經用新的buffer跑了~可是還是沒有18S和28S的band 我在想是不是配膠的問題 因為我是直接拿DNA的agarose gel來跑 請問大大們 有沒有配RNA gel 的配方~~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 220.137.13.140

11/12 01:04, , 1F
不是那個問題..
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11/12 09:10, , 2F
etbr gel要看到band是沒問題的....
11/12 09:10, 2F

11/12 13:45, , 3F
degrade掉了嗎?有沒有smear? 還是連smear都沒有?
11/12 13:45, 3F

11/12 13:49, , 4F
請問你現在到底是怎麼跑膠的呢?
11/12 13:49, 4F

11/12 13:51, , 5F
是什麼樣本?確定操作過程都OK嗎?
11/12 13:51, 5F
文章代碼(AID): #1ElKfShH (Biotech)
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