[期刊] figure判讀

看板Biotech (生命科學)作者 (明智)時間11年前 (2014/12/08 23:02), 編輯推噓0(000)
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期刊名稱:Acetylation of Snail Modulates the Cytokinome of Cancer Cells to Enh ance the Recruitment of Macrophages 第一作者 出版年分: Hsu DS. 2014 Oct 13;26(4):534-48. 文獻網址: http://www.cell.com/cancer-cell/abstract/S1535-6108(14)00365-1 大致內容: 早先我們知道Snail可作為repressor抑制E-cadherin表現而促使EMT的產生。本篇作者討 論說Snail 也可藉由被CBP/p300 acetylation來promote target genes的transactivatio n 其中有一類target genes是cytokine genes,而cytokine genes有很多,在paper中小弟 我不懂為何用ingenuitypathway analysis(IPA)可縮小genes的觀察範圍(差不多在figur e5E處有提到),以及在supplementary中fig S4B如何判讀使作者直接認為TNFalpha ,CCL 2 andCCL5它們在Snail所調控的cytokine中是最重要的呢?而上面明明還有IL-8卻不看它 呢? 小弟學識淺薄 還請各位大大賜教 如有認知上錯誤的 小弟先說聲抱歉 謝謝大家!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 223.143.144.96 ※ 文章網址: http://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1418050950.A.8F4.html
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