Re: [討論] PCR問題

看板Biotech (生命科學)作者 (ABULA)時間7年前 (2017/11/16 18:45), 7年前編輯推噓0(000)
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下午時有被原PO站內信問了一些, 想想覺得把部分節錄出來跟大家分享比較好, 類似的問題就請不要說爬文爬不到啊啊啊。 部分我有稍微修改給大家易於閱讀。 問題: 想再問一下,在聯合醫事檢驗所中 https://goo.gl/HT8wDp 提到HCV屬於RNA病毒, 那聯合只用real-time PCR的話, 這樣會準確嗎? 回答: 先說一下網頁的內容好了, 這網頁的real-time PCR應改為 real-time RT-PCR (reverse transcription-polymerase chain reaction) 在臨床上常用來評估病毒在人體內的含量, 但此法通常用在確認步驟中, 常規上還是以偵測Anti-HCV抗體或HCV抗原為初步篩檢(screening test)。 因real-time RT-PCR是利用PCR中primers對到HCV RNA genome的序列, 因此準確度(accuracy,true positive result)和靈敏度(sensitivity) 通常會比一般的免疫法還要好。 PCR主要是將DNA片段放大之後由儀器偵測後推估原本檢體的DNA量, 但又因HCV是RNA genome, 必須利用reverse transcription將RNA轉成DNA才可以進行PCR, 這也是為什麼我肯定測HCV一定是用RT-PCR, 因為目前沒有辦法直接以PCR放大RNA。 但有一些像transcription-mediated amplification之類的方法可放大RNA片段, 而現今在臨床上的應用還是沒有比RT-PCR好用、技術門檻也比較高。 至於官網的錯誤應該是負責網頁資料的人疏忽, 一般醫檢師還是認得出來是指real-time RT-PCR。 如果你是某個實驗需要此data, 還是建議你找好你的廠牌是什麼、 你所需要偵測的檢體是什麼、 測得的數據要定何種範圍為陽性, 這些都會影響到你驗出HCV的數據判讀, 還有你自己有沒有廠商的陽性對照組和陰性對照組來確認你的檢驗流程是可信的。 你可能有不同的需求,又加上你的背景不是這個... 我想很難有人有辦法回答你。 簡單來說,這方法用在HCV是準確的,但臨床上通常會搭配其它檢驗多次確認。 每個方法都會伴隨不同的真陽性值和真陰性值。 ※ 引述《kk013579 (kk)》之銘言: : 小弟想請教一下 : RT-PCR跟 : real-time pcr是一樣的東西嗎? : 另外real-time pcr可以偵測到rna病毒嗎? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 115.82.255.51 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1510829155.A.D9A.html ※ 編輯: ABULA666 (115.82.255.51), 11/16/2017 18:48:40 ※ 編輯: ABULA666 (115.82.255.51), 11/16/2017 19:01:27 ※ 編輯: ABULA666 (115.82.255.51), 11/17/2017 13:54:26
文章代碼(AID): #1Q3MnZsQ (Biotech)
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