[求救] paper問題拜託幫忙

看板Biotech (生命科學)作者abeautiii (小燕子)時間7月前 (2024/05/06 14:47)推噓1(1推 0噓 12→)

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各位先進好，有一些paper問題想請教 Paper標題：Tissue-resident memory CAR T cells with stem-like characteristics d isplay enhanced efficacy against solid and liquid tumors 連結：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC10313923/ 主要是圖看不太懂，很多圖都是第一次看到，雖然上網查了很多資料，但還是對於paper 圖的意義不理解像Fig.1 的圖A https://i.imgur.com/yXsTY0p.jpeg

Flow的等高線圖越密集應該是代表表現量越高吧，CAR-TRM右上(+,+)和左下(-,-)表現差不多，這是代表什麼意思？ Fig.6的圖I https://i.imgur.com/MXm8Yuq.jpeg

這種圖要怎麼看，CAR-TRM在有無CD103的情況下的表現，框框代表什麼，在框框內外是什麼意思？沒有查到y軸的SSH-H是什麼？ Fig.2的圖A https://i.imgur.com/lzqAQIa.jpeg

第一次看到PCA圖，查的資料都是這是將資料降維，有三種主成份，但還是不懂點的遠近跟位置代表什麼意思 Fig.3的圖A和Fig.S4的圖B https://i.imgur.com/Qa7z1Wr.jpeg

https://i.imgur.com/OxRiPcG.jpeg

也是第一次看到UMAP圖，查到是相似的會聚集在一起？Fig.3這是收集細胞後擴增，利用s cRNA-seq處理，再進行聚類分析，第一張是可以看出三種標記的表現量比較，點的數量就代表表現量嗎？第二張圖的紅點較多代表什麼意思，CAR-TRM的擴增較多？第三張完全看不懂，這是代表細胞主要在哪個階段嗎？是CAR-Tconv還是CAR-TRM，這樣也看不出量多寡，點的位置有意義嗎？ Fig.S4點的數量是表現量嗎？這樣是MKI67表現較多？還是要對照點分佈的位置一起看？拜託各位先進幫忙，可能很多笨問題，但真的研究很久還是不懂，謝謝您們！如果內容太多，留言不太方便，可以站內信，謝謝！ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 223.137.140.21 (臺灣) ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1714978024.A.5F8.html

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