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[問題] depth of small RNA library

看板Biology (生物學)作者 (思考者)時間16年前 (2009/12/19 17:05), 編輯推噓3(3推 0噓 2→)
留言5則, 2人參與, 最新討論串1/1
【問題】： 請問small RNA library 的depth 定義是什麼? 【問題起因】： http://www.nature.com/nm/journal/vaop/ncurrent/abs/nm.2054.html 在這篇paper中，第一頁result第一段 提到建立了small RNA library "to a minimum depth of 4 million tags" 【個人看法】： 看起來depth好像就是指small RNA library裡有多少tags 但是我也不知這tags是什麼@@ 請大家指教 感謝!!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 220.136.169.40
推
12/20 09:47, , 1F
沒看這篇paper 但我想意思就是每個lib最少有4m的reads
12/20 09:47, 1F
推
12/24 02:13, , 2F
tags會不會是指所謂的EST? Expressed sequence tag?
12/24 02:13, 2F
推
12/24 02:27, , 3F
The depth of a genomic library is the number of
12/24 02:27, 3F
→
12/24 02:27, , 4F
times which any single copy sequence can be expected
12/24 02:27, 4F
→
12/24 02:28, , 5F
to be recovered from it. - 查到的資料, 參考
12/24 02:28, 5F
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