[問題] recombinase 重組酶 DNA inversion

看板Biology (生物學)作者時間9年前 (2016/04/30 04:05), 編輯推噓1(1010)
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【問題】: 我們知道有些重組酶像phiC31可以產生不可逆的DNA翻轉,圖示如下 attP >^^^^^^^^> attB (>^^^^^^^^> 表示一段被attP和attB夾住的DNA序列) | | V attR <vvvvvvvv< attL (v 代表 ^ 反轉後的樣子) 如果現在DNA上有多組相同的attP-attB pairs,如下圖 attP_1 >^^^^seq 1^^^^> attB_1 ~~~~~~~~ attP_2 >^^^^seq 2^^^^> attB_2 (~~~~~~~~代表中間不重要的DNA序列 可長可短) 我在想這樣的結構應該attP_1和attB_2夾住的整個DNA序列也有機會整個被翻轉 我想請問各位的是: seq 1和seq 2個別被翻轉的機會會遠比整個序列一起被翻轉大得多嗎? 【問題起因】: 研究上碰到的 但我本身其實是念電子 老闆有興趣 我就被叫來做相關研究了 我已經查了一整天資料 但毫無所獲 到現在都還沒睡覺QQQQ 所以才想上來請問大家 如果有參考資料 方便的話 麻煩各位在提供給小弟了 沒有也沒關係 先謝謝大家了 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 140.112.218.11 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biology/M.1461960338.A.E68.html

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你把P,B,R,L的1跟2的ATCG序列拿來比對是怎麼轉變就了解了
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P1B1可轉成R1L1,但P1B2轉不出可用的R?L?阿
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謝謝樓上回答。但我是假設兩組attP和attB一模一樣 下
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標1和2只是方便讓我解釋問題 那這樣attP1和attB2應
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該也可以變成attR和attL吧?
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coolboychiu:轉錄至看板 Biotech 04/30 21:11

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答案是肯定的 如果在假設Recombinanse的效率沒有距離的影
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響下。翻轉的可能有四種,frag1+2, frag1, frag 2,都不
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轉. 中間兩者只要其中一個發生另一個就會接著發生,中間
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兩者只要其中一個發生第一種情況也不會發生,所以個別翻
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轉的機率會比較同時翻轉高。都不轉的情況是中間兩個attB a
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ttP發生互換
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文章代碼(AID): #1N8xwIve (Biology)
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