Re: [問題]GST fusion protein的問題
如果ligation後,transfermation 到 jm109或其他保菌的e.coli
你塗滿滿個plate後,隔天長出來的,一顆一顆的,你可以做colony PCR或養O/N
隔天用酵素切,如果有的話
那個顆菌還不能叫做是single colony
你必需要把他確定有INSERT的COLONY挑一顆之後,再畫plate,畫成三重覆
隔天再長的單一菌落
再吊他養O/N後,抽plasmid去切酵素看看
如果也是有,這才能確保你的菌只有這個一很純的plasmid
你再抽他的plasmid,再transfermation到會表現的細菌
一樣塗滿再長,隔天會有一顆一顆的菌,你在這就可以直接挑
因為你的plasmid很純,不會有fusion protein only的plasmid在裡面
這樣你了解我的意思嗎?
因為我們之前送定序的結果,常常有雜band
所以老師之後要求我們做三重覆的colony
做了以後,品質會比較好
你可以試試看,但只是參考
※ 引述《churchfire (別小看我...)》之銘言:
: 我在做GST-fusion protein的時候
: 我一開始養小量的試IPTG&溫度&時間
: 後來我在試時間的時候,IPGT濃度固定在0.4mM 溫度25度
: 0、3、6、9小時都收,在跑PAGE的時候其實看不怎麼出來我的蛋白有沒有大量表現
: 我的蛋白(26KD)加上GST(26KD)大約為52KD
: 反觀GST在26KD的位置都有表現!
: 同樣的條件去做western
: 只有3hr的菌有看到微弱fusion protein的band 並有明顯的GST only的band
: 請問這樣的話要怎麼解決呢?因為我後續要做GST pull down看interaction!
: 大家有遇過這樣的問題嗎?我的蛋白推測是transcription factor
: 會不會在產生的過程中,就回去bind在DNA上作用掉了?
: ----------------------------------------------------------------------
: 同樣的我養1L的菌,IPTG 0.4mM 25度 6hr
: 用GST˙Bind Kits(GST˙bind resin)來純化我的fusion protein
: 收下來的 做western, 同樣是微弱的fusion protein的band
: 還有很明顯的GST only的band
: 這樣的話,那我要如何才可以提高我的fusion protein?降低GST protein?
: 希望各位學長姐可以給我點啟蒙!!
: 謝謝
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