Re: [問題] cloning和PCR

看板Biotech (生命科學)作者 (N￾N )時間19年前 (2006/05/14 00:27), 編輯推噓0(000)
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謝謝大大..因你看不到推文 所以回文謝謝你.. 我了解了^^ ※ 引述《everblue.bbs@ptt3.cc (fly fly fly~)》之銘言: : ※ 引述《lakerjackt.bbs@ptt.cc (N￾N )》之銘言: : : 照大大這樣講... : : 那cloning的主要目的是只有放大pcr product和出錯率降低.. : : 那請問為何做第二次時,出錯率會大增? : 舉個例子 : 我用市面上可以proof-read的polymerase : NEB的Phusion好了 : error rate 1/4.4x10^7 : 1th PCR (template=cDNA) : 你PCR的序列2kb, 20個cycle : 2000x2^19=1x10^9 : 你的polymerase要新增1x10^9 nucleotides >> 4.4x10^7 : 如果要算error的話 可能會有23.6個隨機錯誤會產生 : 我這種算法 並沒有累計cycle數 : 假設變異發生在前幾個PCR cycle : 你的PCR產物所有的隨機錯誤可能會更多 : 所以一般人做要cloning的PCR 都會盡量減低PCR cycle數 : 少加點Mg2+ : 寧願少一點產物 也不要有錯的產物 : 照你說的 把第一次PCR產物拿來再amplify一次 : 不就是把那些隨機錯誤繼續以2倍放大.. : 並且再累計更多polymerase新加的錯誤 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 203.204.138.223
文章代碼(AID): #14PWZj-p (Biotech)
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