[求救]primer design之我是新手

看板Biotech (生命科學)作者 (this is me)時間18年前 (2008/02/10 22:14), 編輯推噓0(000)
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大家好呦 最近想要找幾種基因跑 Q-PCR 打算從NCBI找SEQUENCE 用PRIMER 3 來設計 請問一下在用PRIMER 3 設計的時候 大家會考慮到什麼參數呢 我目前只有對Tm 和PRODUCT SIZE有所限制 (我是用syber green系統) 另外 為配合其他基因一起跑 目前同一盤設定的溫度為 annealing temp 60度 elogation temp 72度 請問這樣大家會建議 PRIMER的Tm多少比較好跑呢 最後一個問題就是 我之前請明欣合成PRIMER 他合出來的Tm跟我當初設計的差很多 (低了二十度 70變50) 我反應後 他的理由是每種程式計算TM的方法有差 但是會差到那麼多嗎?? 這樣我的 annealing temp也不知道從哪裡測試了 ︿︿; 有人有碰到跟我一樣的問題嗎 挖真是有點落落長 感謝大家的耐心歐 希望大家新年快樂呦 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.182.172
文章代碼(AID): #17hmRM54 (Biotech)
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