[求救]primer design之我是新手
大家好呦
最近想要找幾種基因跑 Q-PCR
打算從NCBI找SEQUENCE
用PRIMER 3 來設計
請問一下在用PRIMER 3 設計的時候
大家會考慮到什麼參數呢
我目前只有對Tm 和PRODUCT SIZE有所限制
(我是用syber green系統)
另外
為配合其他基因一起跑
目前同一盤設定的溫度為
annealing temp 60度
elogation temp 72度
請問這樣大家會建議
PRIMER的Tm多少比較好跑呢
最後一個問題就是
我之前請明欣合成PRIMER
他合出來的Tm跟我當初設計的差很多
(低了二十度 70變50)
我反應後
他的理由是每種程式計算TM的方法有差
但是會差到那麼多嗎??
這樣我的 annealing temp也不知道從哪裡測試了 ︿︿;
有人有碰到跟我一樣的問題嗎
挖真是有點落落長
感謝大家的耐心歐
希望大家新年快樂呦
--
※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc)
◆ From: 140.112.182.172
討論串 (同標題文章)
以下文章回應了本文:
完整討論串 (本文為第 1 之 7 篇):
Biotech 近期熱門文章
PTT職涯區 即時熱門文章