[求救] 有關gel extraction

看板Biotech (生命科學)作者 (tRoMboNe pLaYer)時間15年前 (2010/03/29 14:38), 編輯推噓4(4024)
留言28則, 7人參與, 最新討論串3/3 (看更多)
想請教板上的各位先進 最近我有一條基因想要送讀序 可是一直無法以gel extraction的方式成功回收 但是因為pcr的產物 量實在是無法增加 所以只能在gel extraction方面加強 以下是我gel extraction的步驟:我使用的是V牌國產的回收kit 切下膠塊以500ul GEX buffer回溶 60 度C加熱10分鐘 反轉2-3次 通入column用vocume method WN buffer500ul WS buffer 500ul 13000rpm 25度c離心3分鐘 加入預熱60度C之EB或者 ddH2O(pH=7) 等待10分鐘 13000rpm 25度C離心3分鐘 以上步驟 不知道到底是哪理出問題了QQ還是說是他們的column有問題? 我測OD值都很低 有時候還測不到東西 縱使有測到 A260/230的值也很低 要做ligation實在有困難QQ 以上 懇請各位指教~ -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 210.241.123.131

03/29 15:28, , 1F
不用做gel extraction也可以送定序吧..廠商好像會幫你做~
03/29 15:28, 1F

03/29 15:29, , 2F
需要的話在跟廠商要sample也可以呀~
03/29 15:29, 2F

03/29 16:57, , 3F
承1F說的,可以拿PCR產物純化後送定序,但有些老闆(師)不喜
03/29 16:57, 3F

03/29 17:00, , 4F
to原po:60度融解gel後,是否有先冷卻(至室溫)?有時若膠太大
03/29 17:00, 4F

03/29 17:00, , 5F
在60度全融,但回到室溫會又有點凝固,這樣回收率會很差~
03/29 17:00, 5F

03/29 17:01, , 6F
以上是我以前遇到的狀況~請加油:)
03/29 17:01, 6F

03/29 17:22, , 7F
treat exonulease I跟SAP~就可以直接送定序~
03/29 17:22, 7F

03/29 17:25, , 8F
打錯是 exonuclease I
03/29 17:25, 8F

03/29 21:40, , 9F
不能一次P個好幾管 再去切交純化嗎@.@?
03/29 21:40, 9F

03/29 21:41, , 10F
我都是加熱30sec invert30sec 直到溶解 就放著等他涼
03/29 21:41, 10F

03/29 21:42, , 11F
可以的話用越少agarose越好 (1% LM agarose 真的很嫩=.=)
03/29 21:42, 11F

03/29 21:44, , 12F
沒看清楚原文, 直接拿PCR產物去定序就好了吧?
03/29 21:44, 12F

03/29 21:45, , 13F
不過這也只保證primer後的50bp~700bp 是可信的
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03/29 21:47, , 14F
如果想要整個完整定序到的話, PCR產物直接接到T/A
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03/29 21:47, , 15F
再抽plasmid去定序?
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03/29 22:52, , 16F
檢視一下protocol,WS buffer有無加入酒精,WS buff 離心完後
03/29 22:52, 16F

03/29 22:54, , 17F
需要不加buffer全速空轉三分鐘去除WS的酒精成分
03/29 22:54, 17F

03/29 22:55, , 18F
膠不要超過2%,總重在200mg較佳。切膠是盲切還是在X光台下?
03/29 22:55, 18F

03/29 22:56, , 19F
我昏頭了XD 我是指UV光台 XD
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03/29 23:00, , 20F
預熱60度C回收大於5k片段時利用,小片段使用一般水2~3min即可
03/29 23:00, 20F

03/30 01:26, , 21F
喔喔喔 沒想到大家這麼熱心(感動中)請受小弟一拜~
03/30 01:26, 21F

03/30 01:26, , 22F
各位說的 我會注意看看~感恩感恩有任何消息我會回報~
03/30 01:26, 22F

03/30 01:28, , 23F
還有就是 因為我是做RACE-pcr所以 非單一產物
03/30 01:28, 23F

03/30 01:28, , 24F
所以要直接送 PCR產物可能不行QQ
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03/30 01:29, , 25F
不過真的很感謝各位熱心的回應~感恩感恩
03/30 01:29, 25F

03/30 01:31, , 26F
切膠是在UV box上面切的
03/30 01:31, 26F

04/10 15:02, , 27F
如果是single band用Q牌的PCR purification kit吧!回收量差
04/10 15:02, 27F

04/10 15:02, , 28F
很多
04/10 15:02, 28F
文章代碼(AID): #1Bi4hWX2 (Biotech)
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