[求救] Confocal螢光定量問題

看板Biotech (生命科學)作者 (mikis1107)時間12年前 (2013/08/17 22:36), 編輯推噓7(7013)
留言20則, 8人參與, 最新討論串1/3 (看更多)
求救求救!!! 之前我用confocal看雙染分子的螢光量 一共三個分子 A B C 主要目的看A+B A+C的% of colocalization程度 第一次雙染 A (紅光,二抗是M)+B(綠光,是已經接上螢光的抗體) 第二次雙染 A (綠光,二抗是M)+C(紅光,二抗是R) -->我知道A應該都染同一種顏色才對 但因為B與C是老闆指定要呈現的顏色所以才把A的顏色換掉 本來想換螢光顏色應該對於其分子的螢光表現量不會差太多 但是現在問題來了!!! 就是有差!! 原本第一次雙染看三組檢體(NC,與其他兩組病人檢體) 螢光量比例為 1:2:2.2 第二次染的檢體螢光比例卻變成 1:2.2:2.7 (螢光量都已經減去各自的background了) 難道同一個分子同樣抗體濃度 染色的condition都一樣的狀態下 (從固定, blocking,一抗濃度二抗濃度,wash時間通通一樣) 染不一樣的螢光表現量會差異到快一倍嗎??@@a 被老闆一問一整個不知道該怎麼回答~ 請問有concocal達人可以幫幫忙嗎?? 有沒有甚麼解釋方法呢?? 感激不盡!! -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 36.238.36.127

08/18 11:16, , 1F
看不太懂 3組檢體是哪三組? 第一次只看A+B嗎?
08/18 11:16, 1F
三組檢體是Normal control(NC) 病人第一組(10位病人) 病人第二組(10位病人) 是的 第一次只看A+B A分子的螢光(紅光) 三組檢體螢光比例是NC:病人1:病人2=1:2:2.2 第二次看A+C A分子的螢光(綠光) NC:病人1:病人2=1:2.2:2.7

08/18 11:19, , 2F
即使同樣抗體濃度不同抗體可能會有差異唷
08/18 11:19, 2F
一抗二抗的濃度都一樣的話也會嗎??

08/18 12:50, , 3F
你要不要寫英文?
08/18 12:50, 3F
哈哈哈哈 我...我英文不太好@@a

08/18 12:54, , 4F
你有用二抗嗎?如果二抗不一樣,強度不同很正常
08/18 12:54, 4F
有二抗 A分子的二抗是Mouse-FITC(綠光) Mouse-TRITC(紅光) 那這樣的話可以跟老闆說 "因為我街的二抗不一樣所以導致A分子螢光強度也有差異嗎??" 但他會問我為什麼會有差異...是甚麼原因造成這種差異性..@@a

08/19 00:01, , 5F
問一下 曝光強度有調成一樣嗎?
08/19 00:01, 5F
你是說紅光跟綠光的曝光程度嗎?? 三組病人在各自雙染的曝光程度一樣沒錯(曝光數值調成一樣) 但是第一次的紅光與第二次的綠光曝光數值不一樣 因為在confocal上看起來 同一個分子染紅光表現量是比綠光來的弱一點點 也就是第一次雙染的A分子是看起來比第二次的A分子弱一點 不過因為都是跟NC做比較 就算表現量稍微弱一點 理論上除起來的倍率應該也要差不多才對吧T__T

08/19 10:59, , 6F
倍率不會一樣吧..
08/19 10:59, 6F

08/19 10:59, , 7F
NC的強度是non-specific binding程度決定 訊號強度是
08/19 10:59, 7F

08/19 11:00, , 8F
Specific binding強度在決定..
08/19 11:00, 8F
喔喔報告學長(姐)XDD NC是指買來的正常組織切片 Normal control 是沒有病的人類檢體切片 A分子也會表現在正常組織中 只是量應該沒有病人多

08/19 11:01, , 9F
不同顏色就是不同抗體 這麼多變數怎麼可以直接比
08/19 11:01, 9F

08/19 11:01, , 10F
除非你的negative control也有訊號 那就當我想太多 XD
08/19 11:01, 10F

08/19 11:11, , 11F
不同的螢光分子激發後的螢光強度會不一樣
08/19 11:11, 11F
嗯嗯 我知道 但是兩次染色三組檢體都是同時處理 跟NC比較起來的倍率是否也應該要接近才是?? ※ 編輯: mikis1107 來自: 114.137.27.122 (08/19 14:27)

08/19 23:47, , 12F
精華區Z>7>16>2>2有討論螢光定量。不曉得confocal跟flow是否
08/19 23:47, 12F

08/19 23:48, , 13F
類似,flow雙染情況下須進行compensation,confocal就不知是否
08/19 23:48, 13F

08/19 23:51, , 14F
也要進行這步驟? 直接請教confocal specialist也是方法之一
08/19 23:51, 14F

08/20 18:12, , 15F
因為你是用比的 有沒有可能第一次染色紅光已經saturate?
08/20 18:12, 15F

08/20 18:13, , 16F
所以倍數拉不開
08/20 18:13, 16F

08/22 18:34, , 17F
同樣一個片子 綠:紅 不等於 紅:綠.
08/22 18:34, 17F

08/23 15:12, , 18F
即使你上述的condition一樣 室溫也是影響反應的原因之一 更
08/23 15:12, 18F

08/23 15:13, , 19F
不用說你二抗用了不一樣的抗體了 如果這樣做出來的數值一樣
08/23 15:13, 19F

08/23 15:13, , 20F
我才覺得比較奇怪
08/23 15:13, 20F
文章代碼(AID): #1I3ug2UK (Biotech)
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