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Re: [工具] 有沒有程式可以從distance matrix作tree

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者 (傷心嗎?)時間16年前 (2008/06/10 03:11), 編輯推噓2(2推 0噓 5→)
留言7則, 3人參與, 最新討論串2/7 (看更多)
※ 引述《afra33 (豆豆)》之銘言： : 現在手上已經有distance matrix了 : 不知道有沒有什麼程式可以從distance matrix : 去做出phylogeny tree? : 我試過phylip的 NEIGHBOR : 不過...她的結果我覺得有點奇怪， : (更重要的是他的output很醜....) : 因為不常用phylip目前還不知道是什麼問題 : 想請問各位大大 : 除了neighbor之外還有沒有什麼程式可以做呢？ MATLAB 是很好用的數學工具 他有許多Cluster的方法 你可以試試看用 hierarchical clustering 來處理 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.114.214.30
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06/10 08:02, , 1F
不記得Matlab有tree display, phylip 網路板的parsing有
06/10 08:02, 1F
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06/10 08:03, , 2F
點問題, 可能你input的時候沒有parse好
06/10 08:03, 2F
推
06/10 11:34, , 3F
Matlab...完全沒用過耶 有這麼容易上手嗎？
06/10 11:34, 3F
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06/10 12:00, , 4F
回一樓 我是已經拿到output結果 沒有error (當然是try很多
06/10 12:00, 4F
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06/10 12:00, , 5F
次以後....^^||) 只是我覺得結果有點醜
06/10 12:00, 5F
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06/10 12:16, , 6F
只是要畫圖的話, google一下網路上很多免費軟體
06/10 12:16, 6F
推
06/12 16:05, , 7F
matlab bioinformatics有clustering，可以畫distance tree
06/12 16:05, 7F
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