Re: [工具] 有沒有程式可以從distance matrix作tree

看板BioMedInfo (生醫資訊)作者時間16年前 (2008/06/12 12:02), 編輯推噓0(000)
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※ 引述《afra33 (豆豆)》之銘言: : 現在手上已經有distance matrix了 : 不知道有沒有什麼程式可以從distance matrix : 去做出phylogeny tree? 如果不想花錢的話可以用MEGA4(但是免費軟體目前大多數paper還是以phylip為主流)  如果願意花100美金的話.那乾脆去弄一套PAUP.... : 我試過phylip的 NEIGHBOR : 不過...她的結果我覺得有點奇怪, 何謂結果奇怪,也許是你有東西設錯? : (更重要的是他的output很醜....) phylip輸出的結果除了output外應該還有一個outtree檔案  該檔案的內容是向量格式(用記事本打開會看到一堆數字) 這種向量檔可以用treeview(直接google應該就找的到)打開  通常會比output的圖漂亮很多 : 因為不常用phylip目前還不知道是什麼問題 : 想請問各位大大 : 除了neighbor之外還有沒有什麼程式可以做呢? -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 140.112.84.219
文章代碼(AID): #18K9_KN8 (BioMedInfo)
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