Re: [工具] 有沒有程式可以從distance matrix作tree
※ 引述《fc01 ()》之銘言：
: ※ 引述《afra33 (豆豆)》之銘言：
: : 現在手上已經有distance matrix了
: : 不知道有沒有什麼程式可以從distance matrix
: : 去做出phylogeny tree?
: 如果不想花錢的話可以用MEGA4(但是免費軟體目前大多數paper還是以phylip為主流）
MEGA4有這個功能歐！
我本來就是使用mega4
可是我沒找到這個功能 ><"
請問是在哪邊呢？
: 如果願意花１００美金的話.那乾脆去弄一套PAUP....
^^P 話說...這也不一定要有錢才有:P
: : 我試過phylip的 NEIGHBOR
: : 不過...她的結果我覺得有點奇怪，
: 何謂結果奇怪,也許是你有東西設錯?
恩 應該是說 ，
因為我不太熟phylip
我直接用人家寫在網頁上的server跑
所以不懂得怎麼改她的參數
因此覺得結果怪也無法更改
: : (更重要的是他的output很醜....)
: phylip輸出的結果除了output外應該還有一個outtree檔案
: 該檔案的內容是向量格式(用記事本打開會看到一堆數字)
: 這種向量檔可以用treeview(直接google應該就找的到)打開
: 通常會比output的圖漂亮很多
我要的就是這類 一堆括號又有名字檔耶！
這是我比較熟悉的
(treeview可以讀的檔)
可能是因為我直街用別人網頁上寫好的server
我沒注意到她有這樣的檔說:P
那我來下載一下phylip好了
謝謝你
: : 因為不常用phylip目前還不知道是什麼問題
: : 想請問各位大大
: : 除了neighbor之外還有沒有什麼程式可以做呢？
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