Re: [問題]有關MSP-如何明確知道promoter的範圍
※ 引述《dropdred (keep the faith)》之銘言：
: 在做MSP(Methylation Specific PCR)偵測promoter region中CpG island甲基化的狀態
: 不是要先知道promoter的位置，然後再選取特定的範圍來偵測CpG island甲基化的程度，
: 想請問：如何知道欲研究的基因的promoter region是從哪裡到哪裡？該如何界定？
: 能提供我如何查資料的方法嘛？
: 謝謝!!
http://genome-www6.stanford.edu/cgi-bin/Traser/traser
這是一個尋找Gene promoter的網站
先去NCBI上查你要找尋的基因的Gene ID
在那塊輸入ID的地方輸入後，再設定你要它輸出的東西
例如：可以設定它輸出promoter的長度（預設為1000 bp）
還有建議你可以選promoter + exon 1的選項
因為有時exon 1也有調控基因表現的重要CpG island存在
若基因有alternative splicing的現象，
要注意其promoter是不是用不同的來驅動表現...等等
大概就這樣吧 祝實驗順利！
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