Re: [問題]有關MSP-如何明確知道promoter的範圍
看板Biotech (生命科學)作者dropdred (keep the faith)時間19年前 (2006/08/03 14:46)推噓0(0推 0噓 0→)留言0則, 0人參與討論串3/4 (看更多)
※ 引述《LuLowDa (...)》之銘言：
: ※ 引述《dropdred (keep the faith)》之銘言：
: : 在做MSP(Methylation Specific PCR)偵測promoter region中CpG island甲基化的狀態
: : 不是要先知道promoter的位置，然後再選取特定的範圍來偵測CpG island甲基化的程度，
: : 想請問：如何知道欲研究的基因的promoter region是從哪裡到哪裡？該如何界定？
: : 能提供我如何查資料的方法嘛？
: : 謝謝!!
: http://genome-www6.stanford.edu/cgi-bin/Traser/traser
: 這是一個尋找Gene promoter的網站
: 先去NCBI上查你要找尋的基因的Gene ID
: 在那塊輸入ID的地方輸入後，再設定你要它輸出的東西
: 例如：可以設定它輸出promoter的長度（預設為1000 bp）
: 還有建議你可以選promoter + exon 1的選項
: 因為有時exon 1也有調控基因表現的重要CpG island存在
: 若基因有alternative splicing的現象，
: 要注意其promoter是不是用不同的來驅動表現...等等
: 大概就這樣吧 祝實驗順利！
非常感謝你的回答，
但是我想更確切的知道基因的promoter...
不單只是序列，
所以想先知道有沒有哪裡有匯整各基因的promoter這種資料庫
還是只能透過文獻搜尋來定義基因的promoter區域
在這方面知道的很少，
所以任何的建議或提醒都非常的感謝各位
再次感謝大家!!
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