Re: [討論] 預測ESEs的方式
發現大家可能不懂我的意思 跟我朋友要了paper給大家參考:
http://www.biomedcentral.com/1471-2105/8/159
※ 引述《realism ()》之銘言：
: 前幾天有個朋友問我關於預測ESEs(Exonic Splicing Enhancer)的問題
: 他說他使用統計的方法來預測 我查了ㄧ下文獻 似乎是因為ESE通常很短
: 要用pattern來預測不是很能夠取信於人 所以會加上統計的方式
: 預測的方式大概是這樣:
: 找出某一個hexamer(已知的幾個ESEs)在水稻的exon的頻率明顯高於intron
: 並且在exon weak splice site的頻率高於在eoxn strong splice site的頻率
: 找出來的hexamer即認定為新的ESEs
: 但是做出來的結果預測出相對於參考文獻 異常高量的ESE
: 我想了想可能跟物種不同 intron的長度
: 與多寡有關係 因為這樣統計的基本條件就已經不同了
: 請問該怎麼解決這種差異呢??
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◆ From: 140.129.77.13
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