Re: [討論] 預測ESEs的方式
...(略)...
: 你既然都可以去得到這些motif
: 你要算這些nt的頻率應該沒有什麼困難的
: 但我認為這樣可能沒有辦法提供什麼有用的證據
: 我有一些想法你可以參考看看
: 由於目前splice的過程有幾個功能比較清楚的protein
: 例如SF2, SC35, SRp40, SRp55等
: 這些protein的ESE matrix已經建立出來了
: 雖然這是在mammalian上的protein
: 我不確定在植物上是否也有類似的機制
: 如果植物上也有類似的機制的話
: 那我們也許可以拿來當作證據
: 你可以先針對你預測到的ESE做cluster<==請問,有什麼軟體可以做motif的cluster
...(略)...
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