Re: [問題] 噬菌體呈現技術
※ 引述《what15 (這是什麼世界!!米蟲~~)》之銘言:
: 【問題】:
: 最近小妹做的實驗數據出來,將噬菌體呈現技術所得的外源基因轉成胺基酸序列之後,
: 上mimox網站做比對後卻看不太懂結果所表達的含意,對於網站上的操作說明又看不太懂
: 想請問是否也有人用過mimox這個程式,可以替我解釋一下使用方法與結果的意義何在嗎?
: 謝謝~~~^^
: 以下為mimox網站的網址
: http://web.kuicr.kyoto-u.ac.jp/~hjian/mimox/
假如說我輸入的數據是
>mimoseq1
LPLHYTLEKTQP
>mimoseq2
FHLEVRNESQSP
>mimoseq3
YHNERPTPESRP
>mimoseq4
SPRSTDSNLPWT
想請教的問題是
(1)按了"run"之後跑出
mimoseq1 LPLHYTLEKTQP-- 12
mimoseq2 FHLEVRNESQSP-- 12
mimoseq3 YHNERPTPESRP-- 12
mimoseq4 --SPRSTDSNLPWT 12
其字母的顏色有什麼代表性嗎??
(2)接著按"Calculate Consensus Sequence"跑出來的表格是怎麼得來的
這與他推論出來的consensus sequence: XHLER[ST]TES[STNQ]XP--
又有什麼關聯性????
(3)最後按了"Running JalView to view and ..."
那些柱狀圖又是代表了什麼??
我知道問題有點多^^",不過誠摯地希望有人能為小妹解釋一下
感謝^^....
--
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