Re: [問題] PCR 越來越神了,麻煩大家幫我解惑

看板Biotech (生命科學)作者 (wenniefrog)時間19年前 (2006/07/18 02:47), 編輯推噓4(401)
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你的主要問題是 剛做好的cDNA作第一次PCR的時候有訊號 可是拿同樣的cDNA再做幾次實驗結果就越來越弱? 如果是這樣的話 很可能真的是cDNA degrade了 cDNA沒有你想像中的強壯 冷凍解凍數次以後很容易降解 我以前會作完cDNA以後馬上分裝 存在-20度 每次就只拿一個batch出來解凍 希望這樣有幫助^^ ※ 引述《goddogic.bbs@bbs.sa.ncyu.edu.tw ( 做easy讓我很busy)》之銘言: : > 我DNA都存在-40度喔 : > 不過如果你們實驗室沒有這樣的冷凍櫃就沒辦法了 : -40嗎 我問問看老師有沒有 : > 只能說 趕快用掉吧 : > 至於你的PCR.. : > 你沒說你不同條件是哪裡不同耶? : 條件是因為另一組引子長度跟GC%不同 所以PCR才換條件 : 這2組引子做出來都沒有nonspecific band : annealing temp 是49度左右 : > 通常越亮表示產物越多 : > 產物越多 表示鏈合反應條件比較不嚴苛 : > (通常是溫度比較低) : > 或是cycle數比較多 : > 如果同樣條件 作不同重複 而有你所說的那個情形 : > 很有可能是DNA degrad了 : 用第一組引子PCR之後,第一次很亮,第二次1/10,第三次...就看不到了 : 這時我也以為cDNA degrade 但是用這一管cDNA (認為應該degrade光) : 用另一對引子: 第一次有band 且很亮 : 但是用這一對再做第二次第三次...看不見了 = = : > 不管怎樣 你最好先做個小實驗 : > 一部分一部分確定 看是哪個環節有問題 : > 就是所有條件都固定 只有一個變因 慢慢試 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc) ◆ From: 130.219.235.253

07/18 09:52, , 1F
嗯 我也是分裝很多 一管大概只有500micro L(1O.D)
07/18 09:52, 1F

07/18 09:54, , 2F
打錯了" O".D
07/18 09:54, 2F

07/18 13:08, , 3F
你的cDNA也未免太多了吧 會不會是定量有問題
07/18 13:08, 3F

12/14 02:36, , 4F
可能RT就有問題了..剛開始還在用RNA在P後來用光就P不出來?
12/14 02:36, 4F

05/26 16:08, , 5F
500uL???? 無敵多...
05/26 16:08, 5F
文章代碼(AID): #14kzirKM (Biotech)
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