[求救] 有關PCR的問題

看板Biotech (生命科學)作者 (polomi)時間10年前 (2015/02/08 20:50), 編輯推噓2(205)
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版上大家好~ 小弟目前正在進行有關E. colo同源重組的實驗, 最終的確認是使用PCR判斷有無成功的插入到genomic DNA上。 如果是失敗的會保留原長度約為1.1KB, 成功的話會改變其長度。 PCR都是使用相同的primer跟相同的溫度條件設定。 萃取完DNA後, 也有使用DNA clean kit做純化的動作。 有測量OD260/280算濃度。 每管每次PCR添加的genomic DNA template都固定約為200~300ng。 使用的polymerase為 ACCU DNA polymerase。 http://www.yeastern.com/Products.php?pid=169&pkid=10&pttype=60 按照原廠建議使用。 primer最終濃度為0.2uM dNTP 最終濃度為 0.1mM 每次都固定50ul 可是最近幾次的PCR都無法出現結果。 有使用先前成功的template做對照。 有附圖說明,請參考。 http://ppt.cc/to8T 均為同時跑PCR的結果。 PCR buffer是先除去template跟polymerase外先混合均勻, 再分別添加的。 各項溫度的設定並未改變。 請問我有哪裡需要再做改變的? 麻煩各位了 -- ※ 發信站: 批踢踢實業坊(ptt.cc), 來自: 120.107.165.123 ※ 文章網址: https://www.ptt.cc/bbs/Biotech/M.1423399817.A.4BE.html

02/08 21:31, , 1F
直接拿菌去跑pcr,如有band,那就是gDNA萃取的問題,
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02/08 21:32, , 2F
如沒有band,那表示重訂primer~~~~~~
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02/08 21:41, , 3F
或者跑一組house keeping gene的primer 測試gDNA
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02/08 21:47, , 4F
house keeping gene?? 不知E coli是哪一個gene?
02/08 21:47, 4F

02/08 21:59, , 5F
16s 算嗎?
02/08 21:59, 5F

02/09 01:06, , 6F
之前粹的gDNA 也是有跟這次一起重新PCR跑嗎?如果有就不
02/09 01:06, 6F

02/09 01:07, , 7F
是primer 問題了,應該是萃取過程出問題
02/09 01:07, 7F
文章代碼(AID): #1Krrk9I- (Biotech)
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