Re: [求救] site-directed mutagenesis
※ 引述《nhxcyge (人生就像個不可逆反應)》之銘言:
: 我現在是做A基因的點突變,
: 用的方法是利用complement primer 25bp,而突變設計在中間
: 利用這組primer做完pcDNA3-A一整圈plasmid,大小約6.7kb
: 目前卡在PCR出來的產物很少很少,以致於做transform後都沒有colony長出來…
: 曾想過把多管PCR產物跑膠(先以DpnI digest)後,把少量的產物集中一起elution
: 但濃度還是很低(1.1 ng/ul)。
: 另外因此突變點位在基因末端(離stop codon約30bp,全長約1.4kb),所以用下述方法
: 心想應該行不通
: F1----------> F2--------->
: ------------------------------------------------------
: ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
: ------------------------------------------------------
: R1<---------
: R2<----------
: 二段PCR產物overlap處為mutation site,不過會變成F1、R1夾出來1300多bp而F2、R2
: 夾出來可能100bp不到的產物,再將二個大小差距那麼大的產物加在一起覺得不太可行。
: 所以想請問版上有人遇過這種狀況嗎?
: Primer重新order過了,Tm值60.XX,PCR用Phusion polymerase。
我的方法不一樣 提供給大家
我的是
P---------m----------->
------------------------------------------------------ m:mutation
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
------------------------------------------------------
<---------------P
這樣做PCR 因為沒重疊所以不太會形成primer dimer 會比較好做
要注意的地方在於我的primer尾端會加phosphate
因為這樣做出來是linear DNA所以之後拿去作ligation......
效率不錯!!我覺得比傳統quickchange好做很多
另外我用的是fynzyme的phusion pfu
這pfu超好用 作的 超準 超快 超多
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單身不代表寂寞,寂寞是走在一個不愛妳的人身邊的時候。
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◆ From: 140.116.253.121
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